Бесшумный флот
После поражения Мьюри Ундзэн от рук Медаки Куроками и её студенческого совета Академия Хаконива временно вернулась к обычному режиму. Однако этот период стабильности прерывается новыми событиями. Медаки, Дзэнкити Хитоёси, Коки Акунэ и Могане Кикаидзиме сталкиваются с угрозой, превосходящей предыдущие по сложности. В академии начинают происходить странные явления, связанные с директором школы. Он скрывает свои истинные намерения и разрабатывает план под названием «Флакон», который предполагает установление тирании и манипуляций, способных поглотить всё вокруг.
Основную опасность представляет группа новых студентов, называющая себя «Партия тринадцати». Эти сверхспособные молодые люди действуют под руководством харизматичного Удо Мияконодзе. Их цель — захват власти и разрушение порядка, восстановленного после предыдущей битвы. Удо обладает мощными способностями и коварными замыслами, что делает его серьёзным противником для студенческого совета. Ситуация усугубляется возвращением старого врага, который ранее был побеждён, но теперь намерен завершить начатое.